DNAプロファイル一致確率ラボ

アレル頻度とハーディ・ワインベルグの規則が、DNAプロファイルの偶然一致確率をどのように作るかを学習できます。

プロファイルを作成

学習用プリセットを選ぶか、各ローカスを開いてアレルと集団頻度を編集します。

5 ローカス
D3S1358 15 / 16
vWA 16 / 17
FGA 21 / 24
D8S1179 12 / 13
TH01 6 / 9.3

教育用シミュレーターです。個人の識別や事件の判定を行わず、検査室の計算に代わるものでもありません。

シグナル波形

プロファイル波形

各ローカスの入力アレルを2本のピークで表示します。高さは頻度の視覚的な目安で、検査室の信号ではありません。
アレルA アレルB ピークの高さは入力頻度に比例
偶然一致確率 -

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ローカスごとの計算
ローカス遺伝子型規則遺伝子型頻度
D3S135815 / 162pq4.16%
vWA16 / 172pq7.92%
FGA21 / 242pq1.54%
D8S117912 / 132pq6.00%
TH016 / 9.32pq11.34%
Zoom 100%
ユーティリティスタジオ

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よくある質問

偶然一致確率とは何ですか?

選択した頻度と仮定の下で、無作為に選んだ血縁のない人が入力プロファイルを持つ確率の推定です。有罪や特定の試料の出所の確率ではありません。

遺伝子型頻度はどう計算しますか?

ホモ接合体にはp²、ヘテロ接合体には2pqを使い、各ローカスの頻度を掛け合わせます。

プリセットの頻度が合成値なのはなぜですか?

学習用の小さな例だからです。実務では検証済みで代表性のある集団データベースが必要です。

2人を比較したり試料を識別したりできますか?

できません。生物試料を受け付けず、プロファイル比較やデータベース検索も行わず、数学モデルだけを扱います。

なぜ小さな確率が判定にならないのですか?

データベース、人物の選択、プロファイルの品質、仮定、専門家の解釈によって意味が変わるためです。

# DNAプロファイル偶然一致確率計算機

このDNAプロファイル確率ラボは、学生や関心のある読者が、小さな常染色体STRプロファイルから確率が生まれる仕組みを、簡略化した集団遺伝学モデルで学ぶためのものです。各ローカスに2つのアレルと頻度を入力します。ハーディ・ワインベルグの規則を適用し、ローカスの頻度を掛け合わせて学習用の偶然一致確率を表示します。

# 遺伝子型の規則

プロファイルの型 計算 意味
同じアレル2つアレル頻度を自分自身に掛けます。
異なるアレル2つ2pq2つのアレル頻度を掛けて2倍にします。
複数の独立ローカス×各ローカスがプロファイル全体の頻度に寄与します。
入力したアレルは波形に、各遺伝子型の頻度は表に表示されるため、計算過程を確認できます。ホモ接合体はp²、ヘテロ接合体は2pqを使い、最後にローカスの値を掛け合わせます。プリセットは公式の集団データベースではなく、学習のための合成値です。

# 集団頻度が重要な理由

アレル頻度は集団データベースから得られる推定値です。参照集団、サンプル方法、データベースの規模、血縁関係、集団構造、検証状況によって解釈は変わります。入力頻度が対象集団を表し、プロファイルが単一由来で、ローカスを独立とみなせる場合に限り、積は血縁のない人々に現れる頻度を推定します。この結果は入力値に基づく条件付きの説明です。人物の選択、血縁関係、混合プロファイル、データベース検索の影響は考慮しません。したがって学習例は、対象集団、方法、不確実性と合わせて読み、単独の結論として扱わないでください。
  • 1つの集団: 比較できないデータベースの頻度を混ぜないでください。
  • 仮定を表示: 血縁のない人とローカスの簡略化された独立性を仮定します。
  • 確率と身元を分ける: まれなプロファイルは出所や有罪の証明ではありません。
  • データを記録: 正式な報告には出典、方法、不確実性、解釈が必要です。

# 教育上の限界

判定ではなくモデルとして使う
小さな偶然一致確率は、個人の同一性や有罪を示すものではありません。計算を学ぶために使い、データの出典、集団、仮定、不確実性を表示したままにしてください。
実際の事件では、人物の選択方法、データベース、混合プロファイル、集団構造、専門家による解釈も記録します。このアプリは電気泳動図を解析せず、尤度比を計算せず、DNAデータベースも検索しません。

参考文献